Основным преимуществом карт НСМЭП является уровень её безопасности. Реализация чиповой технологии в картах НСМЭП существенно увеличивает их безопасность и открывает возможности для внедрения новых сервисов - социальных карт, электронных паспортов и т.д.

Во-первых, национальная платежная система в сравнении с международными платежными системами больше нацелена на особенности и потребности региона.

Во-вторых, она более лояльна в отношениях ценовой политики. В-третьих, гораздо гибче в принятии стратегических решений.

Преимущества карт НСМЭП по сравнению с международными платежными системами– национальная карта обладает встроенным чипом, делающим ее практически недоступной для мошеннических посягательств. Это позволяет владельцу карты надежно защитить свои средства, и даже в случае сбоя во время операции, информация о ней сохраняется в памяти карты, поэтому она может быть закончена в обычном порядке (то есть без блокировки и дальнейшего разблокирования средств по заявлению клиента).

Также стоит отметить низкую себестоимость операции за счет использования off - line технологии, гораздо более низкие требовании к каналам связи, срок использования карт может составлять до 5 лет. Так как карта НСМЭП является чиповой, она может иметь дополнительные свойства и содержать информацию, что позволяет использовать их как техническое средство для обеспечения идентификации клиента, так же она может включать различные дополнительные функции (скидки, дисконтные программы, аукционные и т.д.)